健康管理システムのおすすめ4選を比較【2026年版】料金・機能・選び方

健康診断結果やストレスチェックの管理をExcelや紙で行い、産業医への情報共有や労基署への報告に手間取っていませんか。健康管理システムを導入すれば、従業員の健康データを一元管理し、法定の健康管理業務を効率化できます。

本記事では、主要な健康管理システム4サービスを料金・機能・対象規模の観点から比較したうえで、健康管理システムの基礎知識・タイプ・選び方・料金相場・よくある質問まで解説します。

健康管理システムのおすすめ比較表

※ 料金の安い順に並べています（料金非公開のサービスは末尾）。各社が公開している最小構成の金額で、プランや利用人数により変動します。最新の条件は各サービスの公式サイトでご確認ください。

健診・ストレスチェックの一元管理に強いものから、産業医紹介まで含むものまで特色が分かれます。自社の健康経営の課題に合わせて検討しましょう。

健康管理システムとは

健康管理システムとは、従業員の健康診断結果・ストレスチェック・長時間労働の状況などをクラウド上で一元管理し、産業保健業務を効率化するためのシステムです。就労判定や労基署への報告書作成を自動化できるツールも多く、企業の健康経営を支える基盤となります。

2025年1月には定期健康診断結果報告書の電子申請が原則義務化され、従業員50人未満の事業場へのストレスチェック義務化も2028年までに施行される予定です。こうした法改正への対応の観点からも、健康管理システムの導入ニーズは高まっています。

健康管理システムの主な機能

• 健康診断結果の管理:健診結果をデータ化し、経年変化を一元管理
• ストレスチェック:実施から結果管理、集団分析までをオンラインで完結
• 長時間労働管理:勤怠データと連携し、面談対象者を自動抽出
• 産業医連携:産業医面談の日程調整や意見書の管理
• 法定報告書の作成:労基署への報告書をワンクリックで作成
• 産業医紹介:自社に産業医がいない場合の紹介サービス

健康管理システムのタイプ

健診・ストレスチェック一元管理型

健康診断とストレスチェックのデータ管理に強みを持つタイプです。medimentのように、就労判定や労基署への報告書作成を自動化できるツールが該当します。

人事労務連携型

健康管理業務を人事労務データと連携させ、伴走支援するタイプです。Carelyのように、長時間労働管理までを一元化し、ペーパーレス化を進められるツールが該当します。

健保データ統合・大規模型

健康保険組合の医療費データとも連携し、疾病予防施策まで踏み込むタイプです。WellGoのように、企業・健保・従業員全員が利用できるオールインワン設計のツールが該当します。

産業医紹介・相談連携型

健康管理データの管理に加え、産業医紹介や医師への相談機能を持つタイプです。first callのように、医師ネットワークを活かした相談サービスと一体で提供するツールが該当します。

健康管理システムの選び方4つのポイント

1. 自社の健康管理課題

健診・ストレスチェックの管理を効率化したいのか、産業医との連携や相談体制まで強化したいのかで、適したツールが変わります。

2. 従業員規模と料金体系

従業員数に応じた月額課金が中心のため、自社の規模に見合った料金プランかを確認しましょう。

3. 産業医の有無

自社に産業医がいない場合は、first callのような産業医紹介サービスとセットになったツールを検討しましょう。

4. 健保組合との連携

健康保険組合とデータ連携したい場合は、WellGoのような健保データ統合型のツールが向いています。

おすすめ健康管理システム4選

ここからは、比較表で取り上げた4サービスの特徴を個別に解説します。

mediment|健診・ストレスチェックを一元管理

株式会社medimentが提供する健康管理システムです。従業員の健康データを一元管理し、健康診断やストレスチェックの実施・結果管理をクラウド上で完結できます。就労判定や労基署への報告書作成もワンクリックで行えます。

こんな企業におすすめ:健診・ストレスチェックの管理と報告業務を効率化したい企業

Carely|人事労務と伴走する健康管理

株式会社iCAREが提供する健康管理システムです。健康診断・ストレスチェック・長時間労働管理を一元化し、紙の書類が不要になるペーパーレス化を実現します。月額100〜350円/人とプランの幅が広いのも特徴です。

こんな企業におすすめ:人事労務データとあわせて健康管理を一体的に進めたい企業

WellGo|健保データと連携するオールインワン

株式会社WellGoが提供する健康管理システムです。企業・健康保険組合・従業員全員が利用でき、健診データと医療費データを掛け合わせて疾病予防施策までサポートします。金融機関同等のセキュリティで運用されます。

こんな企業におすすめ:健康保険組合と連携した本格的な健康経営に取り組む大企業

first call|医師相談と産業医紹介を一体で

産業医業務をサポートするクラウド型健康管理サービスです。12万人の医師ネットワークから産業医を紹介するほか、従業員がチャットやテレビ電話で医師に健康相談できます。50名未満向けの専用プランもあります。

こんな企業におすすめ:自社に産業医がおらず、紹介から相談まで一体で依頼したい企業

健康管理システムの料金相場

今回比較した4サービスの実勢価格をもとにすると、料金の目安は次のとおりです(2026年時点の調査)。

• 低価格帯:Carelyのように月額100〜350円/人、first callの医療相談は月額500円〜
• 要見積もり型:medimentのように目的別プランで個別見積もり
• 大規模・健保連携型:WellGoのように初期費用150万円、月額150,000円〜

一般的な相場としては、初期費用は固定制で50万円程度、または変動制で1人あたり1,000円程度、月額は1人あたり50〜500円程度が目安とされています。

健康管理システム導入の流れ

1. 現状の健康管理課題の整理:健診・ストレスチェックの管理方法や産業医体制を整理する
2. 候補の絞り込みと資料請求:課題・従業員規模・料金体系で2〜3サービスに絞る
3. データ移行とトライアル:過去の健診データを試験的に移行し、操作性を確認する
4. 全社展開と運用ルールの整備:産業医・人事労務との連携フローを整備し本格運用する

健康管理システムに関するよくある質問

Q. 健康管理システムの料金相場はどのくらいですか?

1人あたり月額50〜500円程度が目安です。初期費用は固定制で50万円程度、または従業員数に応じた変動制のケースがあります。

Q. 産業医がいない場合でも導入できますか?

first callのように、産業医紹介サービスとセットになったツールがあります。自社に産業医がいない場合は、こうしたツールを検討しましょう。

Q. ストレスチェックの法定義務にも対応できますか?

medimentやCarelyのように、ストレスチェックの実施から集団分析、労基署への報告書作成までを自動化できるツールがあります。

Q. 健康保険組合とのデータ連携はできますか?

WellGoのように、健康保険組合の医療費データと連携できるツールがあります。健保と連携した疾病予防施策を検討している企業に向いています。

まとめ

健康管理システムは、(1)自社の健康管理課題、(2)従業員規模と料金体系、(3)産業医の有無、(4)健保組合との連携の4点を軸に選ぶことが失敗しないコツです。健診・ストレスチェック管理にはmediment、人事労務と伴走するならCarely、健保連携の本格運用にはWellGo、産業医紹介から相談まで求めるならfirst callが有力候補です。まずは気になる複数サービスの資料を取り寄せて比較しましょう。